В декабре 2004 года по заказу Администрации Президента РФ Институтом был реализован научно-исследовательский проект, направленный на изучение  правовых позиций Совета Европы в сфере защиты свободы совести и вероисповедания.

В результате исследования, проведенного группой российских экспертов под научным руководством директора Института Ольги Сидорович, были подготовлены  материалы, в доступной форме представляющие обзор прецедентной практики Европейского Суда по правам человека относительно вопросов свободы совести и вероисповедания. Также был проведен научный анализ существующих стандартов Совета Европы в области защиты указанных прав отдельных граждан и религиозных объединений, а также толкования понятия вмешательства в указанные права.

По завершении проекта было представлено научно-правовое заключение, отражающее основные подходы, применяемые Европейским Судом по правам человека при рассмотрении жалоб на нарушение свободы совести и вероисповедания. Кроме того, в рамках проекта осуществлен перевод на русский язык и редактирование 7 постановлений Европейского Суда, отражающих европейские правовые воззрения на свободу мысли и религии, право менять свою религию и убеждения, ограничение права исповедания.